Es un tipo especial de ultrasonido que consiste en introducir una sonda a través del ano, que mide el ancho de un dedo y aproximadamente 5 cm de largo. Con este estudio se puede observar con precisión la anatomía de los músculos del ano. Este estudio es igual de incómodo que un tacto rectal pero no es doloroso y dura aproximadamente 5-10 minutos.

Realizado en manos expertas, este estudio es muy útil para valorar lesiones del esfínter anal, incontinencia anal, fístulas anales y tumores del ano, entre otras. Actualmente existen el ultrasonido normal en dos dimensiones y el ultrasonido en tercera dimensión. Su médico le indicará cual es el qué le recomienda de acuerdo a su caso.